麦迪逊的修订草案遭到了很多众议员的抵制，因为这些人本身自己都搞不懂到底谁对谁错。虽然修订草案在众议院没有通过，但他这种做法还是得到了一些人的拥护。反联邦主义者对空前强大的联邦政府的怀疑从来没有消失过，汉密尔顿”国债计划会让投资者接近联邦政府而不是州政府”的说法，似乎是这些一直持怀疑态度的人反对该计划的一个好理由。
同时地方保护主义也支持麦迪逊的观点，而开始抵制汉密尔顿的方案。在南方的很多州，扎根泥土的种植园主们占大多数，他们认为自己比北方的资本家在国家的财政方面更值得信赖，因为那些资本家只知道在熙熙攘攘的都市中寻欢作乐。这种看法是不完全准确的，很多南方的种植园主都是身负重债，同时南加利福尼亚州也存在一些支持汉密尔顿的资本家。但是上述观点却足以让麦迪逊在议院的一次初步投票中击败汉密尔顿。
汉密尔顿独自承受了这次失败，他有一种被麦迪逊背叛的感觉并开始抨击对方是一个”对现实缺少认识的聪明人”［28］。汉密尔顿坚信自己提出的国债方案是不可或缺的。他说：”一切都是在以国家信用为中心，这个国债方案是完美的、不容分割的。”［29］
而汉密尔顿没有轻易承认自己的失败，他争取到了国务卿托马斯·杰斐逊的支持。在1790年的夏天汉密尔顿和杰斐逊还只是处于提防对方的阶段，但不久之后两人的关系便破裂了。华盛顿鼓励同事之间建立友情，至少有时候他是这样要求的。6月的时候，华盛顿邀请内阁成员去哈得孙河钓鱼（当时联邦政府已经搬到了纽约），目的是以此为契机加强大家的关系。
当杰斐逊答应在汉密尔顿和麦迪逊两人之间做调解的时候，事情就向好的方向发展了。国债计划渺茫的前景让汉密尔顿感到很沮丧，杰斐逊在华盛顿租住的房子旁边的百老汇碰到汉密尔顿的时候，他整个人显得很疲惫和焦虑。他告诉杰斐逊，新英格兰地区甚至扬言”如果国债计划得到了实施就退出合众国”。在汉密尔顿看来，如果计划没有得到批准的话他自己就该辞去财政部部长一职了。汉密尔顿对杰斐逊坦言，自己就指望依靠当国务卿的杰斐逊帮助了。像麦迪逊一样，杰斐逊本身也不赞同汉密尔顿的方案，但自己身为国家领导层的一员，而不仅仅是作为一个众议员，他本身对那些反对汉密尔顿计划的弗吉尼亚人并没有什么值得顾虑的，所以，最后杰斐逊答应做他能做到的事情。
随后他邀请汉密尔顿和麦迪逊来他家吃晚饭。至于当天晚上他们都说了什么，历史学家至今都没有搞清楚。但有两件事让国会很恼火，那就是国债计划以及国家资本的配置问题在摒弃不久便得到了解决。弗吉尼亚人想让这些钱留在自己的地盘上，以防止纽约和费城的资本家将政府迁到其他的地方。那些资本家是需要这个国债计划的。谈判在杰斐逊的办公桌上进行着，最终北方人得到了他们想要的国债计划而南方人得到了资本。每10年政府都将在费城召开一次会议，但在1800年的时候联邦政府迁到了波拖马可河流经的华盛顿市。
当时三人都不承认有私下交易一事。麦迪逊仍然反对国债计划，汉密尔顿则另行办理国家资本的配置一事，杰斐逊仍扮演秘密调解人的角色。不久，国债计划和国家资本配置两个方案经过最终投票还是被通过了，这时一切才真相大白。杰斐逊承认：”这是国债计划经历的真实历史。”［30］
到这个时候，稍微有一些抱负的人都会开始为自己的未来做打算，将其他的事情留给国会和国民来解决，但汉密尔顿却选择了继续奋斗。联邦政府的国债本可作为货币来流通，但事情却不像想象的那样简单。财政部负责国债的相关事务，但国债的规模问题还是掌握在国会手中的。在汉密尔顿看来，民主主义者手中控制国债的权力太大。为了消除这种影响，汉密尔顿决定成立一家全国性的银行。
于是汉密尔顿开始研究中央银行的相关知识，他特别拜读了亚当·斯密的著作。亚当·斯密堪称苏格兰现代资本家教父，在他的著作《国富论》中就有这样一段描述作为中央银行的英格兰银行所起的作用的话：